Możesz pobawić się TOS w firewallu. Ustawić je tak, żeby po przekroczeniu pewnej ilości przesłanych danych (np. 1MB) na jednym połączeniu obniżało mu priorytet.
W sumie to nie wiem, czy działanie windows jest tu prawidłowe. Jeśli coś ściągasz pełnym łączem, to nie dziw się, że inne downloady rywalizują o pasmo. Windows widać jakoś sam tym zarządza. Tylko z jednej strony nie wiem, czy jest to słuszne, a z drugiej, przy jakości rozwiązań microsoftu potem pliki często dochodzą uszkodzone.
Możesz też po prostu ściągać plik nie pełnym łączem:
wget --limit-rate=70k http://.../plik