Spotkać Cię może informacja, że pliki te nie mogą być otwarte przez obecnego, "nowego" użytkownika i środowisko po prostu się nie uruchomi. Jeśli chcesz to przetestować, to po instalce - 2 użytkowników, jeden "testowy", przerzuć do testowego, sprawdź. Ewentualnie będziesz musiał nadać plikom uprawnienia dla tego użytkownika. Jeśli wszystko ok - można przerzucać do "normalnego" - musisz to zrobić z uprawnieniami root, a następnie nadać tym plikom uprawnienia dla tego użytkownika.
Pytanie po co? Sens to ma w zakresie ewentualnie dokumentów. Wszystkie pliki konfiguracyjne powstaną same po instalacji, a następnie - jeśli potrzebujesz - można to sobie odpowiednio pozmieniać, także posiłkując się starymi ustawieniami.