Do tymczasowego radzenia sobie z problemami, gdzie dwie paczki dostarczają plik o tej samej nazwie (wraz ze ścieżką) służy polecenie dpkg-divert. U Ciebie oba pliki należą do tej samej paczki - libcupsys2 - tyle, że w różnych wersjach, a to dziwne. Niemal zawsze nowa wersja paczki zachowuje położenia swoich plików i dpkg nie burzy się z tego powodu.
Zamiast więc bawić się divertem, proponowałbym wpierw wyczyścić archiwum (apt-get clean), potem odinstalować i ponownie zainstalować libcupsys2 (być może z kilkoma zależnymi paczkami).
Ed. Przepraszam, dopiero zauważyłem różnicę w nazwach paczek, ale nie zaszkodzi i tak odinstalować tej starej (libcupsys2) na rzecz nowej (libcups2).