To jest podobnie jak z silnikami samochodowymi. Dlaczego benzyniak nie pojedzie na ropie? (W starych rosyjskich czy czeskich konstrukcjach możliwe jest żeby diesel na benzynie chodził, chociaż konstruktorzy tego nie przewidywali ;P)
Linux jest innym systemem, posiada swoją odrębną architekturę. Inne nazwy funkcji systemowych, inna organizacja danych w systemie, inna jest organizacja danych w plikach wykonywalnych z windows (exe) a inna w linuksie. itp. itd.
Dzięki emulatorom i różnym implementacjom windowsowego środowiska można pod linuksem uruchomić windowsowe .exe (może nie wszystkie, ale na pewno większą większość), czego nie można powiedzieć o windowsie - nie spotkałem się z żadnym emulatorem linuksa na windows. (Być może źle szukałem)
Pytanie można też zadać w drugą stronę: Dlaczego WINDOWS nie obsługuje LINUKSOWYCH plików wykonywalnych.