hmm... ja osobiście kiedyś korzystałem z Konq jako przeglądarki internetowej, ale wróciłem do FF, bo mi się wydawał wygodniejszy. Najlepiej przez jakiś czas popracuj na jednej a potem na drugiej i sam ocenisz, która ci bardziej odpowiada (również pod względem dostępności różnego rodzaju pluginów itp. oraz pod względem społeczności).
Co do bezpieczeństwa, to ja osobiście nigdy nie słyszałem o jakichś zagrożeniach bezpieczeństwa w Konquerorze, ale to może dla tego, że aż tak się tym nie interesuję.
Jest jeszcze taka kwestia, że niedawno wyszło KDE 4 i jest w nim Konqueror 4. Mógłbyś też tego spróbować, ale samo KDE 4 potrzebuje jeszcze kilku tygodni/miesięcy, żeby zyskało pełną funkcjonalność (obecna wersja 4 posiada na razie podstawową funkcjonalność i w założeniu dopiero od wersji 4.1 KDE będzie przeznaczone dla końcowych użytkowników).
Co do szybkości przeglądarki, to FF3 (na razie jest w wersji testowej) jest szybszy od dwójki więc możesz też poczekać aż wyjdzie wersja stabilna i obczaić.
I jeszcze obsługa standardów (JS, SVG, i inne takie) - pod tym względem FF 2 jest lepszy od Konq 3.5 (ale nie wiem jak będzie w przypadku FF 3 vs Konq 4.1).
No i jest jeszcze Opera i inne, mniej znane przeglądarki - więc wybór masz szeroki;)